W ramach umowy z Województwem Wielkopolskim Gmina Nekla dotuje Poznańską Kolej Metropolitalną na linii Poznań Główny – Września wg rozkładów, które można znaleźć na stronie https://rozklad-pkp.pl/
W ramach porozumienia z Gminą Czerniejewo w Gminie Nekla działają przewozy pasażerskie na linii Czerniejewo – Nekla ul. Poznańska – Nekla ul. Dworcowa (przy Urzędzie Miasta i Gminy) - Nekla PKP. Aktualny rozkład jazdy: https://www.e-podroznik.pl/1504,27138,86707,rozklad-jazdy-pks-czerniejewo-nekla.html
W Gminie funkcjonują również regularne przewozy świadczone przez firmę FHU WA-MA Maciej Walicki na linii Września – Racławki – Targowa Górka – Stępocin – Kokoszki – Nekla – Gierłatowo – Zasutowo – Września. Aktualne rozkłady jazdy na stronie https://wama-transport.pl/rozklad-jazdy/
